一个受雇于政府的专业扒手,遗失一辆速度惊人、设计精良的精品车,而车内藏有一片攸关生死证据的磁片。 昆特,职业扒手,发现失车是一个组织严密的偷车集团所为,而他们藏身于摩天大楼地底的地下组装厂,则由严密精良的高科技保全系统层层把关。昆特必须夺回磁片。仗着自身的小聪明和错误的摩天大楼蓝图,昆特虽躲过监视器和好战的警卫监视,却发现唯一的逃生方法就是驾着死亡快车,自摩天大楼顶端飞出。。某天,毛利侦探事务所接到了知名舞台剧女演员牧树里的委托。委托内容是牧树里收到怪盗基德预告信,信中指出怪盗基德将在舞台上夺取牧树里佩带的蓝宝石戒指“命运的宝石”。于是毛利小五郎接受保护宝石的工作,依据毛利小五郎的推理,基德将在演出的最后一天前来盗取这颗无价的宝石。在演出的最后一天,毛利小五郎、小兰和柯南受邀观赏舞台剧,在剧场里错综复杂的人群中,基德到底会假扮成谁出现在大家面前,在紧张的埋伏等候中,出现在大家面前的竟然是工藤新一,柯南一方面必须保护宝石,另一方面又不能拆穿基德假扮的工藤新一,因为拆穿基德就等于公开自己身体缩小的秘密。柯南只好盯紧假的工藤新一,一刻都不能松懈。就在舞台剧即将落幕之前,柯南发现假的工藤新一不见了,随即追上,但却在一片混乱之中让基德逃脱了。不过,“命运的宝石”终究是保护住了,牧树里为了表示感谢,邀请毛利侦探前往北海道函馆的别墅度假,同行的还有一同演出的其他演员。就在大家都搭上飞机前往函馆的机舱时,一幕精心设计的杀人剧就在大家面前上演了。柯南除了要防止基德再度混入人群中,又要解开发生在飞机上的密室杀人事件,到底柯南要怎么行动呢?。聚焦了异星和阳间之间的千载难逢的比赛,这场比赛将最终决定地球和人类所有的公民的命运。阳间保护者雷电必须聚集其领域最伟大的战士,以从邪恶的尚宗手上保卫阳间,从而结束所有战斗。。