公元2035年,人类被12只猴子军研制的一种病毒侵袭,大部分人类都在这场病毒灾难中死亡,只有少数人侥幸逃生,但也只能在阴暗的地下,苟且偷生。
科学家们决定派人穿越时光回到1996年追查12只猴子军的来历。囚徒詹姆斯·科尔被挑选为志愿者。阴差阳错,科尔回到了1990年,当他向当时的人们描述未来的那场大灾难时,被当作精神病捉了起来并被医生凯瑟琳·雪莉诊断为精神分裂症。科尔在病友杰弗里·戈因斯帮助下逃脱,回到了未来。因为没查清12只猴子军的来历,科尔再次被派回了1996年。
科尔这次发现了12只猴子军的起源地在费城,他找到了医生凯瑟琳,二人一起展开了追查12只猴子军的冒险之旅!。一个女孩在被催眠下,讲出了她身世的秘密,原来她的丈夫在结婚当晚神秘消失,她多方寻找最后发现了丈夫身上的秘密,而她的丈夫竟变成了...。本片是对历史的一种假想,英德间发生了核大战,整个世界笼罩在核爆炸形成的红色烟雾中,到处是战争,到处是血腥的杀戮,人们开始迷失方向,陷入一片恐慌和无聊中……。