公元2029年,未来世界是高科技与信息化的世界。人类生活水平的提高伴随着犯罪活动的高科技化,于是,专门镇压高科技犯罪的特殊部队——公安9课成立了。队长草薙素子,作为一位全身“义体化”的女警,带领公安9课不断展开行动。
是次,公安9课帮助公安6课秘密解决了一位程序员外逃他国的麻烦琐事,又卷入传说中的黑客“傀儡师”的犯罪事件。当行动陷入僵局之际,傀儡师竟然不请自来,出现在公安9课!素子与她的战友们,不知不觉地被卷入了一场涉及政府的阴谋之中。。影片讲述一名少女在人类灭绝后,被一个用于构造生命让人类重现于地球、被称为“母亲”的机器人所创造,成为了新一代人类中的第一位,并且与“母亲”保持着独特的关系,然而一名受了伤的陌生人的到来使得这个关系受到动摇,让这名少女对于母亲告诉自己关于外面世界的一切以及母亲的意图产生了怀疑。。八年前,特工德里克隐姓埋名,重新开始平静的生活。八年的平静生活,因为巴德拉的越狱而惨遭破坏,德里克的身怀有孕的妻子以及小儿子都惨遭毒手。德里克悲伤欲绝,誓要为妻子和孩子报仇,巴德拉会得到他应有的下场。。