进次郎被噩梦所困扰。他梦到了曾经光之巨人奥特曼与怪兽“芝顿”对峙的梦。
而且,他现在遇到了全新的问题,那就是日渐增强的奥特曼之力已经渐渐难以控制了。
就在这段时间发生了假冒机动奥特曼破坏街道的事件。世界上“奥特曼危机”的舆论愈演愈烈,科特队陷入了口诛笔伐之中。
只不过,这些全都是某个外星人的阴谋罢了。其中的幕后黑手居然是艾德!
艾德目的只有一个,终结地球人对于奥特曼的信仰。为此,艾德引导进次郎走向成为光之巨人的道路,然后再打败进次郎。
巨大化的芝顿被艾德召唤并与科特队展开了激烈的战斗。
奥特六兄弟与玛丽装甲集结,并肩作战。
艾德身穿自己的芝顿装甲登场,最后的危机时刻来临。
进次郎也穿上了全新的装甲去迎战对手。。巴里用自己的超能力重返过去,想要改变历史、拯救自己的家人,然而他的所作所为,也在无意间改变了未来。在这个新的未来里,佐德将军回归,并威胁要毁灭世界。巴里孤立无援,除非他能劝动一位非常不同且已隐退的蝙蝠侠重出江湖,并拯救被囚禁的氪星人——尽管这位并不是他所熟悉的超人。最终,为了拯救他身处这个世界,并回到他熟知的未来,巴里惟一的希望就是为命运而极速狂奔。不过,即使巴里做出最终极的牺牲……他真的能让整个宇宙都重归正轨吗?。